喀什大学办公室是学校党委和行政的综合办事机构。其主要职能是围绕学校中心工作，积极发挥学校的信息枢纽、部门的综合协调、决策的落实督办等作用，服务领导，服务部门，服务基层。具体工作职责有：

1.负责组织起草学校综合性党政工作报告、总结、计划和决议等文件；负责拟定全校性的党政规章制度；负责学校上报或下发文件的审核、修订、打印、送文及归档工作；负责以学校党政工作有关信息和办公室的名义发布有关布告、通告和公告。

2.负责学校事业统计报表工作；负责学校各部门对外报送数据的审核工作。

3.负责上级党政领导机关来文的批阅、传阅、督办、催办及文书档案的立卷、归档工作。

4.负责组织安排校级党政会议日程、议程，会议记录，并督促检查会议决议的执行情况。

5.负责组织协调学校综合性党政工作，协调办理校内突发事件，承办全校性大型会议、活动等。

6.负责协调学校的外联工作，处理对外公共关系有关事宜；负责上级机关和外单位领导来校的接待工作。

7.负责学校机要交换和公函邮寄传真工作；负责学校维稳和安全保密工作。

8.负责学校信访接待工作，安排校领导接待日、回复校长信箱。

9.负责学校荣誉称号的管理；负责学校校名、校徽的管理与规范使用。

10.负责学校党委、行政印章、办公室印章及校领导名章、介绍信和证照等的管理和使用；负责各单位印章的核制、启用。

11.负责制定全校作息制度，安排节假日放假和值班等有关事宜。

12.负责档案馆的相关工作。

13.负责校领导交办的其他事宜。